Грепнем количество fpm процессов, заданное в конфиге fpm:

grep ^pm.max_children /etc/php5/fpm/pool.d/www.conf

Далее грепнем количество fpm-процессов, которые работают в данный момент:

• pgrep fpm | wc -l
• ps axu | grep -c fpm

Если количество fpm близко или равно параметру max_children, то fpm воркеры не справляются.

Не всегда проблему нужно решать увеличением количества процессов. Нужно разобраться, почему процессы тормозят (если они на самом деле тормозят).

$ grep ^pm.max_children /etc/php5/fpm/pool.d/www.conf
pm.max_children = 128

$ pgrep fpm | wc -l
97

Как временное решение, можно освободить воркеры fpm перезапуском php5-fpm:

sudo service php5-fpm restart